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区农业农村委员会设6个内设机构：

一、办公室。负责机关日常运转，承担文秘、会议、信息、公文、公章、档案、后勤管理、狗万客户端等工作。负责重点工作任务的协调督办和接待联络工作。负责安全、信访工作。负责值班值守管理工作。负责委机关财务、资产和政府采购管理工作。

二、农业产业发展科。制定农业产业发展政策、规划。组织协调乡村产业发展。指导现存特色产业、农产品加工业、休闲农业发展。指导粮食、蔬菜、畜产品渔业生产。承担农业新品种保护工作，组织实施农作物种质资源保护与管理。推动农业机械化、智能化发展。承担农产品品牌建设相关工作。承担农业农村信息化有关工作。指导农业防灾减灾。

三、农村社会事业科。协调推动农村社会事业、农村文化发展和公共服务体系建设。牵头组织改善农村人居环境，统筹指导村庄整治、村容村貌提升。建设美丽宜居村庄，改善农村生活条件，协调推动农村基础设施建设。负责农业教育、职业农民培训和农村实用人才培训规划。负责农业固定资产投入和农业统计工作。参与农村金融、农业保险的政策制定。

四、农经管理科。承担全面深化农村改革和管理、农民承包地改革和管理、农村集体产权制度改革有关工作。指导农村集体经济组织发展和集体资产管理工作。提出培训新型农业经营主体政策措施和扶持家庭农场建设发展。指导农民合作经济组织、农业社会化服务体系和农村经营管理体系建设。指导农村集体经济组织财务会计管理和审计监督工作。负责农村宅基地改革与管理有关工作。

五、林业绿化科（农业资源科）。拟定并组织实施林业和农村绿化规划。负责林业资源的清查、监测和统计。组织编制并组织实施全区森林防火规划及防护标准并指导实施。提出农田建设项目需求建议。负责农田整治项目、农田水利建设项目管理工作。指导农村可再生能源开发利用、节能减排、农业清洁生产、生态循环农业建设及农业生物质产业发展。

六、农办秘书科。承担区委农村工作领导小组办公室具体工作，组织开展“三农”重大问题政策研究，协调督促有关方面落实区委农村工作领导小组决定事项、工作部署和要求等。提出农业农村改革发展相关重大政策建议。提出实施乡村振兴战略的政策建议。起草本区农业农村经济发展规划。协调推进乡村治理体系建设。牵头全区乡村振兴战略的实施。